SDS:离子去污剂，0.01%即可完全抑制PCR反应，0.005%可显著降低产量

 苯酚:0.5%即可完全抑制PCR反应，0.2%可显著降低产量

 乙醇:大于1%的浓度可抑制PCR反应，但在某些体系里又能增加产量

 异丙醇:抑制作用比乙醇稍强

 乙酸钠:大于5mM时抑制PCR反应

 氯化钠:大于25mM时抑制PCR反应（生理盐水无影响）

 EDTA:0.5mM可使PCR产物减少，1mM完全没有PCR产物

 血红素（heme）-来源：血液，大于1mg/ml抑制PCR反应

 氯高铁血红素（hemin）：大于0.1ng/μl抑制PCR反应

 丹宁酸（tannic acids）：大于0.1ng/μl抑制PCR反应

 肝素：大于0.15IU/ml抑制PCR反应

 尿素-来源：尿，大于20mM时产生抑制

 腐殖质-来源：土壤，植物材料，自然界水

 植物多糖-来源：粪便，植物多糖

 聚苯乙烯，聚丙烯-来源：紫外线照射塑料管

 胆酸盐-来源：粪便

试纸瓶

 胶原质-来源：组织

 靛青染料-来源：粗斜纹棉布，牛仔裤

 蛋白酶-来源：牛奶

 钙离子-来源：牛奶，骨头

 铁离子-来源：血液

 二甲苯胺

 溴酚兰

 胆红素（bilirubin）

 其他抑制剂

血糖试纸亲水膜

  除上述抑制剂外，还存在一定的PCR增强剂，比如甜菜碱、二甲基亚砜、甲酰胺、甘油、PEG、亚精胺和单链DNA结合蛋白等，但是在高浓度情况下，也会对PCR产生抑制，因此如何采用增强剂消除抑制剂的影响，采用多少的浓度对结果都存在很大的影响。